La fréquence fondamentale correspond à la fréquence de vibration des cordes vocales. L’estimation de la fréquence fondamentale continue d’être un champ de recherche actif malgré le nombre d’algorithmes qui ont été proposés. Deux catégories distinguent les algorithmes fondés sur une représentation temporelle de ceux traitant le spectre du signal. Les méthodes temporelles utilisent la similarité du signal d'une période à l'autre pour identifier la période fondamentale. Le décalage observé entre le signal de départ et une répétition de ce signal indique la période du signal. Les méthodes spectrales s’appuient sur les harmoniques de la fréquence fondamentale. Hess (1983 ; 1992) et Hermes (1993) proposent des revues de ces algorithmes. Quelques exemples de méthodes sont 40 :
La plupart de ces méthodes sont disponibles sur Internet.