Comme dans tous les pays de missions, le passage de l'Eglise missionnaire aux Eglises diocésaine s'est également caractérisé au Gabon par une profonde transformation de l'épiscopat et du clergé. Cette transformation est inséparable des mutations institutionnelles des années 1950.
Avant 1960, le Gabon n’avait pas d'évêques nationaux. Cela constituait un retard pour ce vieux pays de mission 320 . Après l'érection du Vicariat de Libreville en diocèse en 1955 et sa division en deux en 1958, le Saint-Siège se hâta de nommer un gabonais évêque : l'abbé François Ndong. Un second fut nommé huit ans plus tard en 1969 en la personne de l’abbé André Fernand Anguilé.
Le Gabon a été le premier pays d’Afrique noire au Sud du Sahara dans lequel les missionnaires catholiques de la Congrégation du Saint Cœur de Marie se sont installés en 1844.