1) Mesure de l’atrophie cérébrale

Le module SIENAX de la plateforme de traitement d’images du logiciel FSL (http://www.fmrib.ox.ac.uk/fsl/) permet de mesurer le degré d’atrophie cérébrale. SIENAX effectue une mesure entièrement automatisée du volume du cerveau à patir des images anatomiques T1 après une normalisation relative à la taille de la tête. Suite à la segmentation du cerveau et du crâne des images IRM, l’image cérébrale se voit recalée dans l'espace de référence MNI152 (Montreal Neurological Institute) par une procédure de recalage.

Ensuite, une segmentation des différents types de tissus cérébraux (Substance Blanche (SB) et Substance Grise (SG)) est effectuée pour calculer le volume total du cerveau. Les résultats volumétriques sont donnés avec et sans normalisation par rapport à la taille du crâne.